MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pCA2.4_M

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020289	ATT	2	6	15	20	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020289	CAT	2	6	96	101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020289	ATT	2	6	225	230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020289	AAT	2	6	240	245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020289	ACT	2	6	338	343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020289	TCC	2	6	493	498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_020289	TATT	2	8	502	509	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020289	GGA	2	6	665	670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816540
9	NC_020289	CCTGAC	2	12	1037	1048	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	451816540
10	NC_020289	TTA	2	6	1212	1217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816540
11	NC_020289	AAG	2	6	1258	1263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816540
12	NC_020289	GAA	2	6	1281	1286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816540
13	NC_020289	CGA	2	6	1403	1408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816540
14	NC_020289	GAA	2	6	1425	1430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816540
15	NC_020289	TAG	2	6	1456	1461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816540
16	NC_020289	GAC	2	6	1569	1574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816540
17	NC_020289	AATG	2	8	1640	1647	50 %	25 %	25 %	0 %	451816540
18	NC_020289	TTA	2	6	1663	1668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020289	TTG	2	6	1788	1793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020289	AAC	2	6	1901	1906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816541
21	NC_020289	CCTG	2	8	1922	1929	0 %	25 %	25 %	50 %	451816541
22	NC_020289	AAT	2	6	2006	2011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816541
23	NC_020289	GGA	2	6	2018	2023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816541
24	NC_020289	ATT	2	6	2030	2035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816541
25	NC_020289	AAG	2	6	2040	2045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816541
26	NC_020289	ACCATT	2	12	2204	2215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020289	ATG	2	6	2283	2288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020289	CTA	2	6	2343	2348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.